真正的新疆墨玉是因为石墨入侵到白玉当中而形成的，所以灯光照色是可以看到白玉地张，并且带有星星点点的黑点。墨玉中以漆黑者为上品，但是只要其边缘也是能够透光的。
和田墨玉呈灰黑—黑色，致色因素是因为含有一定量的石墨包体，墨玉是杂质致色，墨玉的黑色由内部的石墨包体所致。墨玉的颜色经常是不均匀的，黑色呈花斑、条带状分布。在鉴别中应注意与绿黑色碧玉、黑色青玉、黑色烟青玉的区别。
墨玉含有石墨，石墨晶体呈片状，若晶片比较大，在光线的照射下应该可以看到片状的反光，薄片石墨晶体呈现金褐色反光，厚片呈现银灰色反光。墨玉透不透光线要看厚度，薄一点墨玉片还是透光的。墨玉中颜色浅一些的可以透光，透不透光还要看厚度。墨玉的透明度比较低，但玉质感还是有的，有些墨玉只是黑，没有玉质感，也不能算是好的墨玉。
墨玉即使在强光照射下观察也是黑色。墨玉的基底可以是白玉、青白玉、青玉等多种玉质，其中以白玉基底沁入石墨形成的墨玉最为美观，市面上见到的也比较多。
由于含石墨量多少不同，墨玉的黑色深浅分布不均，墨玉原料习惯上被称为“青花料”，青花的“青”在这里就是黑色的意思，一般情况下黑色含量或色率达到40%以上就可以称为墨玉。
烟青玉、黑碧玉容易与墨玉混淆
青海烟青玉，与新疆和田玉同产自昆仑山，烟青玉是青海玉中较为特殊的存在，其与墨一样有着黑白两种色调，但是青海烟青玉和新疆和田墨玉鉴别也不是很难，烟青玉的黑白两色过渡自然，有过渡色，而这是和田墨玉没有的。
新疆黑碧玉，其颜色近墨色。在正常光线下，它是呈漆黑色，如用借助强光照其边缘能够看到时透着绿光。因为新疆黑碧玉本质是碧玉，价格跨度大。这种玉石的鉴定一看漆黑，二看灯下玉质里是否有黑点。其品质越纯、越通透，就越值钱。
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