和田墨玉一般颜色呈灰黑色到黑色，玉质细腻亮丽。墨玉的颜色，它是由翠绿色进过漫长的时间，在宇宙射线的作用下慢慢至深变黑生长成的。然而我们在市场上看到的类似的黑色玉石并不都是墨玉，还有一种黑碧玉，是比较容易搞混的。
和田墨玉的颜色形成与石墨有关，所以在白玉底上可见一些星点的墨色。墨玉与其他有色于是一样，颜色越浓郁价值越高，墨如漆最为珍贵。当然墨玉虽然是以墨色浓郁为贵，但是其边缘最好能透光，不然极易被看做黑色石头。在墨玉中还有一种黑白分明的青花料也极其受到坊间的喜爱，作为俏色玉雕的玉材。
和田墨玉容易与一些玉石相混淆，要注意鉴别的方法。
墨玉与黑碧玉在外观上很相似，黑碧玉是碧玉的一种，因其颜色过于浓郁而近似黑色，但只要用强光照射它，透过光我们会看到它呈一种墨绿色。而和田墨玉是真的墨色玉，用光照还是呈墨色，只是可能颜色有些浅。
坑瓦石玉产于玉河之中，从外观上看与墨玉十分相似，但是，与墨玉不同的是它在阳光的照射下质地并不透光，而且玉质也不具油性，摸起来有些干涩。所以鉴别的时候只需要观察其质地便能分辨出二者。
烟青玉属于青海玉石的一种，是比较特殊的存在。它和和田墨玉一样，拥有黑白两种色调，但是它的黑白色调过渡自然，中间有过渡色，没有明显的颜色界限。而和田墨玉不同，它的黑白两色界限明显清晰，无过渡色。
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